Standar Operasional Prosedur laboratorium dibuat untuk membantu memperlancar pengelolaan laboratorium guna mengoptimalkan penggunaan laboratorium beserta semua sumber daya yang ada di dalamnya, sehingga dapat membantu mewujudkan visi dan misi dari Fakultas Tarbiyah IAIN Kudus. Kegiatan yang ada di lingkup pengelolaan  laboratorium meliputi praktikum, peminjaman peralatan, diskusi ilmiah, riset, dan kerjasama.